Die Katholisch-Theologische Fakultät besteht seit der Gründung der Universität im Jahr 1582. Derzeit gliedert sich die Fakultät in vier Institute mit 17 Lehreinheiten sowie eine Nachwuchsgruppe. Die aktuell knapp 700 Studierenden werden von über 60 Professor*innen und wissenschaftlichen Mitarbeiter*innen betreut. Das Studienangebot umfasst die Studiengänge Magister theologiae, Bachelor und Master Theologische Studien sowie das Studienfach Katholische Religionslehre im Rahmen eines Lehramtsstudiengangs. Darüber hinaus besteht die Möglichkeit zu einer Promotion und Habilitation.